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Key Takeaways

Regla del plazo más largo: Conserve los registros de nómina durante el plazo federal, estatal o basado en eventos que sea aplicable por más tiempo cuando los requisitos se superpongan.

Plazos de las agencias: Por lo general, la FLSA exige de dos a tres años, mientras que los registros de impuestos laborales del IRS deben conservarse durante al menos cuatro años.

Almacenamiento de información confidencial: Utilice sistemas digitales controlados con cifrado, límites de acceso, copias de seguridad, registros de auditoría y calendarios de conservación que permitan realizar búsquedas.

Diferencias entre estados: Los empleados remotos y las leyes estatales pueden añadir obligaciones, por lo que debe revisar la ubicación de cada trabajador antes de establecer los calendarios.

El tiempo durante el cual deben conservarse los registros de nómina depende del registro y de las leyes aplicables. La legislación federal generalmente exige conservar los registros de nómina entre dos y seis años (o incluso más). El IRS exige cuatro años, mientras que la Ley de Normas Laborales Justas (FLSA) exige entre dos y tres. Otras leyes pueden exigir una conservación más prolongada y, cuando varias normas se superponen, prevalece el plazo más largo. 

Conservar los registros durante un período demasiado corto puede dejarle expuesto durante auditorías, disputas salariales y litigios, pero conservarlo todo indefinidamente crea riesgos innecesarios de seguridad y almacenamiento. Esta guía desglosa los principales requisitos de conservación por agencia y tipo de registro, y luego explica cómo almacenar, organizar y destruir de forma segura los registros cuando finaliza el período de conservación obligatorio (y qué software de nómina es el más adecuado para ayudarle).

Cuánto tiempo conservar los registros de nómina

El tiempo durante el cual debe conservar los registros de nómina depende del tipo de registro. Este es un resumen rápido:

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Tipo de registroPeríodo de conservaciónLey o agencia reguladora
Registros de impuestos laborales (W-2, W-4, 941, registros de depósitos y documentación del EIN)4 añosIRS
Formulario I-93 años desde la fecha de contratación o 1 año después de la terminación, lo que ocurra más tardeUSCIS, DHS
Registros básicos de nómina y salarios (registros de nómina y convenios colectivos)3 añosFLSA, DOL
Registros de licencias conforme a la FMLA (solicitudes, fechas, horas, disputas, políticas y pagos de primas)3 añosFMLA, DOL
Registros complementarios de nómina (tarjetas de control horario, horarios, tablas de tarifas salariales y comprobantes de trabajo a destajo)2 añosFLSA, DOL
Documentación de equidad salarial y registros que demuestren el cumplimiento de la igualdad salarial2 añosLey de Igualdad Salarial, EEOC

Las leyes estatales pueden ampliar cualquiera de estos períodos (por ejemplo, Nueva York, que exige conservar los registros durante 6 años, y California, que exige conservarlos durante 4 años). Compruebe siempre los requisitos de cada estado en el que tenga empleados.

Josh Barker

La regla fundamental

Conserve cada registro de nómina al menos durante el período más largo exigido por cualquier ley federal o estatal aplicable y, después, añada un año adicional como margen de seguridad. El IRS exige cuatro años, pero la mayoría de los profesionales fiscales recomienda conservar los registros durante al menos siete. El mínimo legal y el mínimo práctico rara vez son el mismo número.

¿Qué son los registros de nómina?

Los registros de nómina incluyen cualquier documento utilizado para calcular, verificar o informar la remuneración de los empleados. Esto incluye registros salariales, horas trabajadas, retenciones fiscales, detalles de deducciones, elecciones de beneficios y acciones laborales como contrataciones, ascensos y terminaciones.

Los siguientes registros constituyen el conjunto de datos principal detrás de cada pago que emite su empresa:

  • Datos identificativos del empleado: Incluyen el nombre legal completo, el número de la Seguridad Social, la dirección particular, la fecha de nacimiento, el sexo y la ocupación
  • Datos de remuneración: Incluyen la tarifa salarial horaria habitual, la base de pago (por hora, salario fijo, trabajo a destajo o comisión), los ingresos ordinarios diarios o semanales, la remuneración por horas extra de cada semana laboral, los salarios pagados en cada período de pago y la fecha de pago y el período cubierto.
  • Datos de horas: Incluyen las horas trabajadas cada día, las horas trabajadas cada semana y el día de la semana y la hora del día en que comienza la semana laboral.
  • Deducciones y adiciones: Incluyen deducciones por impuestos federales y estatales, Seguridad Social y Medicare; embargos y retenciones por manutención infantil; contribuciones al seguro médico y a la jubilación; y adiciones como bonificaciones, comisiones y propinas.

¿Durante cuánto tiempo exige la FLSA conservar los registros de nómina?

Registros de 3 años (datos básicos de nómina y salarios)

El Departamento de Trabajo exige a los empleadores conservar los siguientes registros durante un mínimo de tres años:

  • Registros de nómina que muestren todos los salarios pagados en cada período de pago
  • Convenios colectivos
  • Registros de ventas y compras utilizados para calcular los salarios
  • Certificados relacionados con las exenciones de la FLSA

Guárdelos en su centro de trabajo o en una oficina central de registros. Los investigadores del DOL pueden solicitar en cualquier momento ampliaciones, cálculos o transcripciones de estos registros.

Registros de 2 años (documentos complementarios y justificativos)

Los registros en los que se basan los cálculos salariales deben conservarse durante al menos dos años. Estos incluyen:

  • Tarjetas y hojas de control horario
  • Tablas de tarifas salariales
  • Tickets de tarifas por pieza
  • Horarios de trabajo y de control horario
  • Registros de pedidos, envíos y facturación
  • Registros de adiciones o deducciones de los salarios

Estos proporcionan pruebas de respaldo para las entradas de su registro de nómina. Si un investigador del DOL necesita reconstruir cómo se calculó un importe salarial, solicitará estos registros.

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Particularidades de los empleados no exentos y exentos

La FLSA exige distintos niveles de detalle según la condición de exención del empleado.

  • Empleados no exentos: Debe registrar las horas trabajadas cada día y cada semana, la hora del día y el día de la semana en que comienza la semana laboral, la tarifa horaria habitual, el total de ingresos por tiempo ordinario, la prima por horas extra de cada semana y el total de salarios pagados en cada período de pago.
  • Empleados exentos: Los registros deben mostrar la base sobre la que se pagan los salarios y el salario total de cada período de pago. No es necesario controlar las horas diarias, pero debe documentar por qué el empleado cumple los requisitos para la exención. Conserve las descripciones del puesto y las pruebas de funciones archivadas junto con los registros salariales por si alguna vez se cuestiona la clasificación.

¿Durante cuánto tiempo exige el IRS conservar los registros de impuestos laborales?

El IRS exige conservar todos los registros de impuestos laborales durante al menos cuatro años después de la fecha de vencimiento de la declaración correspondiente al período o de la fecha en que se pagó el impuesto, lo que ocurra más tarde.

En términos prácticos, así funciona el calendario: supongamos que presenta el Formulario 941 del cuarto trimestre del año fiscal 2025 (con vencimiento el 31 de enero de 2026). En ese momento comienza el plazo: debe conservar todos los registros justificativos hasta al menos el 31 de enero de 2030. Si presentó la declaración fuera de plazo, realizó un pago tardío, presentó un Formulario 941 modificado o emitió un W-2 corregido, el plazo comienza a contar desde la fecha posterior.

Josh Barker

Author's Tip

\u003cspan style=\u0022font-weight: 400;\u0022\u003eUna auditoría del IRS que detecte deducciones no justificadas o registros de depósitos faltantes dará lugar al rechazo de las deducciones, la liquidación de impuestos adicionales, intereses acumulados desde la fecha de vencimiento original y sanciones que agravan el perjuicio.\u003c/span\u003e

Entre los registros específicos que el IRS espera que conserve se incluyen:

  • Documentación del Número de identificación del empleador
  • Copias de todos los Formularios W-2 entregados a los empleados
  • Formularios W-4, W-4P, W-4R, W-4S y W-4V cumplimentados por los empleados
  • Formularios W-9 de contratistas independientes
  • Presentaciones trimestrales del Formulario 941 o anuales del Formulario 944, y números de confirmación
  • Fechas e importes de los depósitos de impuestos federales, con números de confirmación del EFTPS
  • Registros de todos los pagos de salarios, anualidades y pensiones, incluidos los importes y las fechas
  • Importes de las propinas declaradas por los empleados y registros de las propinas asignadas
  • Valor justo de mercado de los salarios pagados en especie
  • Valoraciones de beneficios complementarios y documentación justificativa del reembolso de gastos
  • Períodos e importes de la remuneración por enfermedad

Registros de contratistas independientes

Las relaciones con contratistas generan obligaciones de conservación de registros que van más allá de presentar un 1099. Conserve los Formularios W-9 y copias de los formularios 1099-NEC durante cuatro años, al igual que los registros fiscales de los empleados. Conserve también los documentos que respalden la clasificación: el contrato, pruebas de cómo el trabajador controla su horario y sus métodos, las facturas y la correspondencia que demuestre la relación.

Dada la frecuencia de las controversias sobre la clasificación errónea y la postura firme que han adoptado el IRS y el DOL en este asunto, conserve la documentación de clasificación durante al menos seis años. Si un trabajador es reclasificado como empleado, podría deber impuestos atrasados, sanciones e intereses correspondientes a todo el período transcurrido desde el inicio de la relación.

Requisitos de conservación del Formulario I-9

Conserve el Formulario I-9 durante tres años después de la fecha de contratación o un año después de la fecha de finalización del empleo, lo que ocurra más tarde. Para un empleado contratado el 15 de enero de 2024 y cuyo empleo finalizó el 1 de marzo de 2025, conservaría el I-9 hasta al menos el 15 de enero de 2027, ya que esa fecha (tres años después de la contratación) es posterior al 1 de marzo de 2026 (un año después de la finalización del empleo).

Guarda los formularios I-9 por separado de los expedientes generales del personal. Durante una inspección gubernamental, entregarás los formularios I-9 para su revisión. Mantenerlos en una carpeta física o digital separada evita que los inspectores accedan a información confidencial no relacionada con la auditoría de los formularios I-9.

Otras leyes federales que afectan la conservación de registros de nómina

FMLA (Ley de Licencias Médicas y Familiares)

Conserva todos los registros relacionados con la FMLA durante tres años. Esto incluye las solicitudes de licencia, las fechas y horas de licencia tomadas, los registros de cualquier disputa entre el empleador y el empleado, copias de tus políticas de la FMLA y la documentación de los pagos de primas del seguro médico realizados durante los períodos de licencia.

Aunque un empleado nunca tome una licencia conforme a la FMLA, conserva los registros que establezcan su elegibilidad. Guarda estos registros junto con los registros de nómina, ya que las licencias suelen estar directamente vinculadas a los datos de compensación.

ERISA (Ley de Seguridad de los Ingresos de Jubilación de los Empleados)

La ERISA exige conservar los documentos del plan, los informes anuales y los registros de las transacciones durante seis años a partir de la fecha en que se presentó el informe o tuvo lugar la transacción. Esto abarca los planes 401(k), los planes de pensiones y los planes de beneficios sociales, como el seguro médico patrocinado por el empleador.

Seis años es el período estándar de conservación federal más largo con el que se encontrarán la mayoría de los empleadores. Dada la complejidad de las disputas relacionadas con los planes de beneficios, conserva estos registros durante siete años para mayor seguridad.

EEOC, Ley de Igualdad Salarial y Título VII

Conserva los registros que demuestren el cumplimiento de la igualdad salarial durante dos años. Esto incluye las evaluaciones de puestos, los estudios salariales y cualquier documentación que muestre cómo estableciste los niveles de compensación para los distintos puestos.

En el caso de los registros de personal y de medidas laborales, como decisiones de contratación, ascensos, transferencias y despidos, consérvalos durante un año a partir de la fecha de la medida.

ADA y ADEA

Conserva los registros relacionados con cualquier medida de personal durante un año después de que se haya tomado la medida. Si se presenta una denuncia por discriminación, debes conservar todos los registros pertinentes hasta la resolución definitiva de la denuncia o de cualquier litigio resultante.

Esta es un área en la que muchos empleadores se llevan una sorpresa. Una vez presentada una denuncia, tu obligación pasa de regirse por una norma basada en el tiempo a una norma basada en un acontecimiento. Destruir registros durante un litigio pendiente puede dar lugar a sanciones judiciales. En el momento en que recibas una notificación de una reclamación, emite una orden de conservación de pruebas para cada persona y sistema que intervenga en los registros pertinentes.

Cómo y dónde almacenar los registros de nómina de forma segura

Almacenamiento en papel, digital y basado en software

  • Archivadores de papel: Son comunes en las pequeñas empresas. Son sencillos y no requieren software. Sin embargo, el papel se deteriora, ocupa espacio físico y puede destruirse. Si utilizas papel, guarda copias en un archivador ignífugo y mantén copias de seguridad fuera de las instalaciones.
  • Archivos de documentos escaneados: Ofrecen un punto intermedio. Escaneas los registros en papel para convertirlos en archivos PDF y los almacenas en servidores locales o unidades externas. Esto protege contra la pérdida física, pero sigues gestionando la organización por tu cuenta.
  • Nómina basada en la nube y plataformas de HRIS: Esta es la opción que recomiendo. Plataformas como QuickBooks, Gusto, ADP y Paychex almacenan los datos de nómina, aplican controles de acceso e incluyen funciones de conservación. Los registros tienen copias de seguridad, se pueden buscar y son accesibles. Muchas plataformas ofrecen programación de la conservación que marca los documentos cuya fecha de destrucción se aproxima, así como clasificación de documentos asistida por IA que reduce los errores manuales de archivo.

¿Los registros electrónicos son legalmente equivalentes a los originales en papel?

Sí, con ciertas condiciones. El IRS y el DOL aceptan sistemas de almacenamiento electrónico conforme al Procedimiento de Ingresos 98-25, siempre que el sistema pueda reproducir registros legibles y claramente comprensibles, incluya controles razonables para garantizar la integridad y evitar modificaciones no autorizadas, y pueda producir copias impresas cuando se soliciten.

Esto significa que puedes escanear los originales en papel y destruirlos, pero solo si tu sistema de almacenamiento electrónico cumple estas normas. No almacenes los documentos escaneados como archivos de imagen básicos en una unidad compartida sin control y sin registro de auditoría. Utiliza una plataforma de nómina o un sistema de gestión documental con controles de acceso, historial de versiones y protocolos de copia de seguridad; así tendrás una base jurídica sólida.

Requisitos de seguridad y confidencialidad

Los registros de nómina contienen datos confidenciales: números del Seguro Social, datos de cuentas bancarias e información salarial.

Implementa controles de acceso basados en roles para que solo el personal autorizado pueda consultar o modificar los registros. Utiliza cifrado para los registros digitales durante su transmisión o cuando estén almacenados. Cierra con llave los archivadores físicos y restringe el acceso a las llaves. Muchos estados tienen leyes de privacidad de datos con requisitos para proteger la información personal de los empleados, así que revisa las normas de cada estado en el que operes.

Cuándo y cómo destruir los registros de nómina

La conservación excesiva crea sus propios riesgos. Cada documento que conserva más allá de su período de conservación obligatorio amplía su exposición durante la fase de descubrimiento de pruebas en un litigio, aumenta los posibles daños derivados de una filtración de datos y añade costos de almacenamiento que se acumulan año tras año.

Una vez que un registro ha superado su plazo de conservación y no existen disputas, auditorías ni suspensiones de conservación por litigio pendientes que amplíen la obligación, debe destruirlo. Sin embargo, la destrucción debe ser sistemática, documentada y defendible:

  • Crear un calendario de destrucción: Al menos una vez al año, revise sus registros comparándolos con su política de conservación e identifique los documentos que hayan cumplido los períodos de conservación obligatorios.
  • Utilizar métodos de destrucción segura: Los registros en papel deben triturarse en tiras cruzadas o ser incinerados por un proveedor certificado de destrucción. Los registros electrónicos deben eliminarse permanentemente mediante métodos que impidan su recuperación, no simplemente trasladarse a una papelera de reciclaje.
  • Mantener un registro de destrucción: Por cada lote de registros que destruya, documente los tipos de registros, el intervalo de fechas, el período de conservación, la fecha de destrucción y el método utilizado. Esta es su evidencia de que la destrucción fue rutinaria y se basó en una política, no selectiva ni sospechosa.
  • No destruya nunca registros durante una disputa: Si hay una queja, reclamación, auditoría o demanda abierta o prevista, emita una suspensión de conservación y suspenda la destrucción rutinaria. Destruir registros puede dar lugar a sanciones judiciales, instrucciones al jurado para que extraiga inferencias adversas o algo peor.

Prácticas recomendadas para evitar errores en la gestión de registros de nómina

Los errores más comunes en la gestión de registros de nómina que observo pueden evitarse por completo:

  • Archivado incoherente: Algunos registros se digitalizan, otros permanecen en papel y otros están en el cajón del escritorio de un gerente. Elija un sistema y hágalo cumplir.
  • Mezclar los formularios I-9 con los expedientes de personal: Esto crea problemas de confidencialidad durante las inspecciones gubernamentales. Mantenga los formularios I-9 en un expediente separado.
  • Depender únicamente del papel sin copias de seguridad: Una inundación o un incendio en la oficina, y años de registros desaparecen.
  • Comprobar únicamente el período de conservación de una ley: Un empleador que conserva los registros durante tres años conforme a las normas de la FLSA aún puede infringir el requisito de cuatro años del IRS.
  • No actualizar los calendarios de conservación cuando cambian las leyes: Los períodos de conservación federales y estatales sí cambian, y su política debe reflejar las normas vigentes.
  • Desechar los registros demasiado pronto durante disputas abiertas: Si se ha presentado una queja o reclamación, no se aplican los plazos normales de conservación.

Para solucionar estos problemas:

  • Implementar un software de nómina con alertas automatizadas de conservación: La mayoría de las plataformas modernas indicarán cuándo un documento se aproxima a su fecha de destrucción.
  • Realizar una auditoría anual de conservación: Una vez al año, revise lo que conserva y confirme que se ajusta a los requisitos federales y estatales vigentes.
  • Designar un custodio claro de los registros: Una persona debe ser responsable del calendario de conservación y del cumplimiento.
  • Crear una política escrita de conservación de registros: Documente sus períodos de conservación, métodos de almacenamiento y procedimientos de destrucción. Compártala con sus equipos de recursos humanos y nómina.

Consecuencias y sanciones por incumplimiento

Hay varios riesgos y sanciones por incumplimiento que debe tener en cuenta:

  • Exposición ante el DOL y la FLSA: Los registros de nómina inadecuados pueden dificultar la defensa frente a reclamaciones salariales y de jornada laboral. Cuando faltan los registros obligatorios, los empleados pueden basarse en estimaciones razonables del trabajo no remunerado, lo que podría dar lugar al pago de salarios atrasados, daños liquidados y honorarios de abogados.
  • Sanciones del IRS: La falta de registros de impuestos laborales puede impedirle justificar declaraciones de impuestos, deducciones o créditos, lo que podría resultar en impuestos, intereses y sanciones adicionales.
  • Riesgo de litigios relacionados con la nómina: Las hojas de horas, los registros salariales y demás documentación de nómina incompletos pueden debilitar su posición en disputas sobre salarios, horas extra, deducciones y beneficios.

Complejidades de una plantilla distribuida en varios estados y del trabajo remoto

Muchos estados imponen períodos de conservación más largos que los exigidos por la legislación federal. Varios estados también exigen conservar los recibos de nómina o estados de ingresos durante períodos específicos, o establecen que determinados registros estén disponibles para los empleados cuando los soliciten. Esto va más allá de lo exigido a nivel federal y puede tomar desprevenidos a los empleadores cuando contratan personal en una nueva jurisdicción.

Los equipos de trabajo remotos e híbridos generan una complejidad adicional. Un solo empleado que trabaje desde casa en otro estado puede activar las obligaciones de conservación de registros de ese estado. Como regla predeterminada, aplica el requisito estatal más prolongado correspondiente a cualquier empleado que trabaje o haya trabajado en un estado determinado, y añade por debajo los mínimos federales. Si California exige cuatro años y la FLSA exige tres, conserva el registro durante cuatro años. Si Nueva York exige seis años y el IRS exige cuatro, consérvalo durante seis.

Preguntas frecuentes

¿Tengo que conservar los registros de nómina de los empleados despedidos?

Sí. La terminación de la relación laboral no pone fin a tus obligaciones de conservación. Cada registro debe conservarse durante todo el período obligatorio correspondiente, contado desde la fecha de inicio pertinente (la fecha de contratación, la fecha de la acción, la fecha límite de presentación de la declaración o la fecha de terminación, según el tipo de registro y la legislación aplicable). Para la mayoría de los registros, tendrás que conservarlos durante varios años después de que el empleado se marche.

¿Qué ocurre si pierdo los registros de nómina en un incendio o desastre natural?

Debes documentar inmediatamente la pérdida, notificar a las agencias pertinentes si hay una auditoría pendiente y reconstruir todo lo que puedas a partir de extractos bancarios, declaraciones fiscales, copias de seguridad de la plataforma de nómina y registros de los empleados. La pérdida de registros no elimina tus obligaciones legales, pero demostrar un esfuerzo de buena fe por mantener y reconstruir los registros puede mitigar las sanciones. Esta es una de las principales razones para utilizar almacenamiento en la nube o mantener copias de seguridad fuera de las instalaciones.

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Josh Barker

Soy la People Operations Manager en Black & White Zebra en Vancouver, donde superviso todo el ciclo de vida del empleado, desde la adquisición de talento hasta la gestión del desempeño. Construí desde cero el marco de reclutamiento de BWZ y utilizo datos para impulsar mejoras enfocadas en el rendimiento. Antes de este puesto, lideré contrataciones de ciclo completo en GitLab y logré un crecimiento del 60 % del personal en Aequilibrium. Poseo un Black Belt en Reclutamiento por Internet y una Licenciatura en Geografía Humana.