10 Mejores Programas de Facturación y Nómina de 2026

QuickBooks Workforce es una plataforma de nómina y autoservicio para empleados que gestiona el procesamiento de nómina, declaración de impuestos, facturación, seguimiento del tiempo y administración de beneficios dentro del ecosistema de QuickBooks.

¿Para quién es mejor QuickBooks Workforce?

QuickBooks Workforce es una opción natural para pequeñas y medianas empresas que ya utilizan QuickBooks Online y desean la nómina y la facturación en un solo sistema conectado.

Por qué elegí QuickBooks Workforce

Elegí QuickBooks Workforce como uno de los mejores para el acceso en tiempo real a recibos de pago porque el portal de empleados permite a cada miembro del equipo ver al instante sus recibos de pago y formularios W-2, tanto en escritorio como en la aplicación móvil, en el momento en que se procesa la nómina. Si se suma eso a las opciones de depósito directo para el mismo día o el día siguiente, los empleados no quedan esperando ni adivinando sobre su salario. También me gusta que los empleados puedan actualizar su propia información de depósito directo y datos fiscales directamente en el portal, lo que reduce los intercambios entre el personal y RRHH.

Características clave de QuickBooks Workforce

• Nómina automática: Ejecuta la nómina automáticamente para empleados asalariados con depósito directo según un cronograma establecido, sin intervención manual en cada ciclo.
• Declaración de impuestos automatizada: Calcula, presenta y paga los impuestos federales y estatales sobre la nómina en tu nombre, incluidas las declaraciones de fin de año.
• Presentación electrónica de 1099: Genera y presenta electrónicamente formularios 1099 para contratistas directamente a través de la plataforma.
• Integración de facturación: Conecta los datos de nómina con QuickBooks Online para que puedas gestionar la facturación, los gastos y la nómina desde una sola cuenta.

Integraciones de QuickBooks Workforce

QuickBooks se integra con más de 800 aplicaciones populares de negocios a través de su marketplace de aplicaciones, incluidas herramientas como Shopify, PayPal, Square, Mailchimp, Gusto, QuickBooks Time, Amazon Business y Housecall Pro. También está disponible en Zapier y cuenta con una API para integraciones personalizadas.

Gusto ayuda a las pequeñas y medianas empresas a gestionar tanto la facturación como la nómina en una sola plataforma, para que no tengas que manejar sistemas separados para cobrar a los clientes y pagar a tu equipo. Es especialmente útil si tu empresa necesita herramientas sencillas que administren los pagos entrantes y los impuestos de nómina sin flujos de trabajo complicados.

Por qué elegí Gusto

Elegí Gusto porque combina funciones de nómina y facturación de una manera fácil de adoptar para propietarios de pequeñas empresas o equipos de RR.HH. que son nuevos en estas tareas. Puedes crear facturas personalizadas, permitir que los clientes paguen por transferencia bancaria o tarjeta de crédito, y recibir los pagos directamente en tu cuenta bancaria a través de sus herramientas de facturación.

En el lado de la nómina, Gusto permite realizar nóminas ilimitadas, calcula y presenta automáticamente los impuestos y realiza depósitos directos, para que puedas pagar a empleados y contratistas con confianza. Su panel de nómina se sincroniza con beneficios y el registro de tiempo, lo que significa que pasarás menos tiempo cambiando entre sistemas y corrigiendo errores de datos. Además, los empleados pueden acceder por sí mismos a recibos de sueldo, formularios de impuestos e información sobre beneficios, lo que reduce las consultas administrativas.

Funciones clave de Gusto

Estas son algunas funciones clave que vale la pena destacar:

• Facturación personalizada: Crea y envía facturas personalizadas y enlaces de pago para que tus clientes puedan pagar por transferencia bancaria o tarjeta.
• Presentación automática de impuestos: Gusto calcula, retiene y presenta automáticamente los impuestos de nómina federales, estatales y locales.
• Autoservicio para empleados: Los miembros del equipo pueden ver recibos de sueldo, formularios de impuestos y detalles de beneficios sin la intervención de RR.HH.
• Sincronización de horas con nómina: Cuando añades horas o tiempo libre, esta información fluye directamente a la nómina para reducir la entrada manual de datos.

Integraciones de Gusto

Las integraciones incluyen QuickBooks, Xero, FreshBooks, Expensify, Homebase, Deputy, TSheets (QuickBooks Time) y Asana.

Remofirst es una plataforma de servicios de empleo global que ofrece herramientas para contratar y gestionar un equipo internacional, incluyendo servicios de empleador registrado, gestión de nóminas, administración de beneficios y soporte para el cumplimiento normativo.

Por qué elegí Remofirst: Me gusta que Remofirst tenga una plataforma integral de RRHH que incluye funciones como cálculos automáticos de nóminas, auditorías de cumplimiento y gestores de cuentas dedicados para soporte. Además, la capacidad de la plataforma para gestionar leyes y normativas locales en contratos de empleados y administración de beneficios facilita la contratación internacional, ya sea de empleados asalariados o contratistas.

Características destacadas e integraciones:

Características incluyen herramientas para la gestión de visados y permisos de trabajo, gestión de la fuerza laboral y provisión de equipos, asegurando que las empresas puedan gestionar eficientemente las necesidades de su equipo global. También incluye una calculadora de costes laborales que permite determinar el coste de contratar a alguien en otro país.

Integraciones incluyen ADP.

Deel te permite gestionar nóminas, pagar a contratistas y administrar facturas en más de 150 países mientras se encarga de las normativas fiscales locales, contratos y cumplimiento por ti. Si tu equipo trabaja con empleados o contratistas internacionales, Deel te ayuda a centralizar la nómina y los pagos globales en un solo lugar.

Por Qué Elegí Deel

Elegí Deel porque hace que el pago de nóminas y la facturación internacional sea manejable para empresas que operan en varios países. Puedes pagar a empleados y contratistas en monedas locales mientras Deel gestiona los cálculos fiscales y deducciones legales específicas de cada país de forma automática.

Sus herramientas integradas de facturación permiten que los contratistas emitan facturas conformes directamente en la plataforma, reduciendo la gestión manual, y también me gusta que Deel respalde la contratación como Employer of Record (EOR), por lo que puedes emplear personal a tiempo completo en el extranjero sin crear entidades legales en otros países. Para equipos que están creciendo internacionalmente, esta combinación de apoyo para nóminas, facturación y cumplimiento es difícil de igualar.

Características Principales de Deel

Aquí tienes algunas características clave a destacar:

• Procesamiento de Nóminas Globales: Ejecuta nóminas conformes en varios países con gestión automática de impuestos y deducciones.
• Facturación de Contratistas: Los contratistas generan facturas directamente en Deel según contratos y condiciones de pago aprobadas.
• Pagos en Múltiples Monedas: Paga a los trabajadores en sus monedas preferidas utilizando transferencias bancarias locales u otros métodos de pago soportados.
• Gestión de Cumplimiento: Aplica automáticamente las leyes laborales locales, normativas fiscales y la documentación requerida por país.

Integraciones de Deel

Las integraciones incluyen QuickBooks, Xero, NetSuite, BambooHR, Greenhouse, HiBob, Workday, Ashby y Expensify.

Keka HR es una plataforma unificada de RRHH, nómina y automatización de servicios profesionales que combina la gestión de nóminas en varios estados de EE.UU., seguimiento de tiempo, facturación de proyectos y facturación a clientes en un solo sistema.

¿Para quién es mejor Keka HR?

Keka HR es ideal para empresas de servicios profesionales—como agencias, consultorías y compañías de TI—que facturan a los clientes por horas de empleados y necesitan que la nómina se gestione en la misma plataforma.

Por qué elegí Keka HR

Elegí Keka HR porque gestiona el ciclo completo de facturación de proyectos de forma nativa. Las horas facturables pasan de las hojas de tiempo a facturas T&M o de Hitos sin necesidad de exportar manualmente. También me gusta el modelo de facturación por Retenedor, que permite a mi equipo configurar facturas recurrentes a clientes en un calendario fijo junto con las ejecuciones de nómina estándar. Es una combinación que rara vez encuentro en una plataforma de RRHH.

Funciones clave de Keka HR

• Portal de autoservicio para empleados: Permite a los empleados acceder en línea a recibos de pago, formularios de impuestos, hojas de tiempo y registros de gastos reembolsables.
• Reembolso de gastos automatizado: Permite vincular gastos a proyectos y enlazar automáticamente los reembolsos aprobados a la nómina o facturas.
• Informes y análisis personalizados: Permite a los equipos generar paneles de control que monitorizan los costes de nómina, estados de facturas y KPIs financieros.
• Cumplimiento de seguridad de datos: Sigue los estándares SOC 2 e ISO 27001 para la protección de datos de nómina y facturación.

Integraciones de Keka HR

Keka HR ofrece integraciones nativas con QuickBooks, ADP, Gusto, Paylocity, Paychex, Paycom, Salesforce y Slack. Hay una API disponible para integraciones personalizadas.

TimeTrex es un software integral de gestión de fuerza laboral que ofrece a las empresas una solución todo en uno para gestionar nómina, facturación, control de tiempo y asistencia, y otras funciones de RR. HH.

Por qué elegí TimeTrex: La plataforma ofrece un motor de nómina sofisticado capaz de manejar estructuras y procesos de pago complejos. Calcula automáticamente los impuestos federales, estatales y locales, garantizando el cumplimiento de todos los requisitos normativos. Además, las funciones de facturación de TimeTrex permiten a las empresas crear y gestionar facturas directamente desde la plataforma, integrándose perfectamente con los datos de nómina para asegurar una facturación precisa. 

Funciones y integraciones destacadas:

Funciones como cálculos de nómina en tiempo real, soporte multimoneda, depósito directo, deducciones personalizadas, presentaciones de impuestos automatizadas, recibos de pago digitales, informes personalizables, portal de autoservicio para empleados, registro de tiempo y asistencia, costes por trabajo, programación, gestión de ausencias, gestión documental y seguimiento de gastos.

Integraciones incluyen QuickBooks, Sage, ADP, Xero, Microsoft Dynamics, Paychex, Gusto, FreshBooks, Zoho Books y NetSuite.

Patriot simplifica la contabilidad y la nómina para pequeñas empresas al ofrecer productos integrados tanto para Nómina como para Contabilidad. Es reconocido por su asequibilidad, proporcionando una solución integral sin una carga financiera significativa.

Por qué elegí Patriot: Seleccioné Patriot Software por su excepcional equilibrio entre costo y funcionalidad. Se distingue de otras herramientas de facturación y nómina por sus precios competitivos, lo que lo convierte en una opción ideal para pequeñas empresas. Lo considero el mejor en cuanto a asequibilidad debido a su capacidad de ofrecer características vitales de contabilidad y nómina a un precio accesible para operaciones más pequeñas.

Sus productos de Contabilidad y Nómina son separados, aunque estrechamente vinculados si compras ambos.

Funciones y integraciones destacadas:

Las funciones que hacen que Patriot Software destaque incluyen facturación ilimitada, configuración y soporte gratuitos, y la ausencia de contratos a largo plazo. Admite contabilidad basada en efectivo y devengo, y los usuarios pueden procesar la nómina en tres sencillos pasos. El software se integra con varias herramientas esenciales, aumentando su utilidad para los negocios.

Su producto de Contabilidad también ofrece conciliación de cuentas, subcuentas, presupuestos, herramientas de facturación recurrente, recordatorios de pago de facturas y herramientas de gestión de recibos.

Su producto de Nómina cubre múltiples tasas de pago, depósito directo en 2 días, pagos a empleados o contratistas, formularios W-2 electrónicos o imprimibles, y la opción de presentar electrónicamente los formularios 1099 directamente ante el IRS.

Las integraciones incluyen QuickBooks Online, Shopify, WooCommerce, Xero, Zapier, Clover, Square, PayPal, Gusto y ADP.

QuickBooks es una solución integral de contabilidad que simplifica la gestión financiera para las empresas. Es ideal porque ofrece una variedad de herramientas empresariales que atienden diversas necesidades, desde la contabilidad hasta la nómina.

Por qué elegí QuickBooks: Elegí QuickBooks para esta lista porque proporciona un conjunto sólido de funciones esenciales para empresas de todos los tamaños. Su versatilidad y la amplitud de herramientas disponibles lo convierten en una opción destacada para gestionar las finanzas de manera integral. Considero que QuickBooks es ideal para herramientas empresariales diversas porque ofrece una amplia gama de funcionalidades que van más allá de la contabilidad básica, incluyendo procesamiento de nómina, control de tiempo y soluciones de pago, todo integrado en una sola plataforma.

Funciones y integraciones destacadas:

Las funciones incluyen contabilidad automatizada, procesamiento de facturas y pagos, deducciones fiscales e informes completos. Estas herramientas están diseñadas para automatizar tareas tediosas, permitiendo a los propietarios de negocios enfocarse en el crecimiento. 

Las integraciones están disponibles de forma nativa con numerosas otras herramientas, incluyendo TurboTax, Shopify, Square, PayPal, TSheets, Gusto, Bill.com y muchas más, lo que facilita un flujo de trabajo eficiente en distintas operaciones empresariales.

Xero es una plataforma de contabilidad en la nube integral diseñada para pequeñas empresas y contadores. Es ideal para la contabilidad en línea porque ofrece acceso a datos financieros en tiempo real desde cualquier lugar, agilizando los procesos financieros y la toma de decisiones.

Por qué elegí Xero: Elegí Xero para esta lista por su capacidad de integrarse con una gran cantidad de instituciones financieras a nivel mundial, lo que la convierte en una opción destacada. Considero que Xero es la mejor opción para la contabilidad basada en la nube debido a su accesibilidad, actualizaciones en tiempo real y herramientas de gestión financiera completas que responden a las necesidades de los dueños de pequeñas empresas modernas.

Características e integraciones destacadas:

Las características incluyen emisión de facturas en línea, conexiones bancarias, contabilidad en múltiples monedas e informes financieros detallados. Los usuarios pueden seguir y pagar facturas a tiempo, gestionar gastos, conciliar transacciones bancarias y obtener una visión clara del flujo de caja, cuentas por pagar y por cobrar.

Las integraciones están disponibles de forma nativa con una amplia gama de herramientas, incluyendo Gusto, Avalara, Wagepoint, Payevo, Jibble, Humi, Timedock, Oyster, Payworks, Knit, Rise, Rippling, Remote, Deel, Hubdoc, Stripe, PayPal, WorkflowMax, Square, Expensify, Vendy, Deputy y Shopify. También se conecta con más de 21,000 instituciones financieras a nivel mundial, permitiendo la alimentación automática de datos bancarios y la conciliación.

Wave es una herramienta integral para la gestión financiera de pequeñas empresas. Es reconocida como la mejor opción para software financiero gratuito, ofreciendo un conjunto de herramientas básicas de finanzas y facturación sin costo alguno.

Por qué elegí Wave: Elegí Wave para esta lista porque ofrece una solución financiera básica para pequeñas empresas y autónomos sin cobrar tarifas, lo cual es bastante inusual. Se diferencia de otros programas de facturación y nómina al no cobrar por funciones básicas, incluyendo la contabilidad, facturación y la posibilidad de aceptar pagos en línea. 

Funciones e integraciones destacadas:

Las funciones incluyen herramientas de facturación, contabilidad y gestión de flujo de efectivo, todas disponibles de forma gratuita. Si pasas a su plan de pago, Wave también ofrece escaneo de recibos y conexiones directas con cuentas bancarias y tarjetas de crédito para la importación automática de transacciones, lo que simplifica la contabilidad.

Las integraciones están disponibles de forma nativa con Google Sheets, PayPal, Stripe, Etsy, Shopify, Shoeboxed, Zapier, Mailchimp, Square y RBC (Royal Bank of Canada).